意根は五蘊から独立しているようでありながら独立しておらず、五蘊と和合しているようでありながら和合しておらず、五蘊から離脱できるようでありながら離脱していない。なぜこのようであるのか。意根が五蘊から独立していないのは、意根の持つすべての思(し)、すべての想法と意志は、必ず五蘊を通じて実現され完成されなければならないからであり、それゆえ意根は五蘊を我とみなすのである。一方、五蘊の運作は、また意根の思を強化し啓発するため、五蘊は意根を中心にぐるぐると回り、意根もまた五蘊を中心にぐるぐると回り、互いに絡み合って分離できない状態となっている。
意根が完全に五蘊から独立できるのは次の理由による。(一)最初に世界がまだ建立される以前には、五蘊はなく、第八識と意根だけが存在していた。(二)正死位においては、五蘊は滅し、第八識と意根だけが存在している。(三)受精卵位において、五蘊がまだ生起していないときには、第八識と意根だけが存在している。(四)滅尽定の中では、五蘊の中でごく微弱な色蘊だけが存在し、六識の受想行識蘊はいずれも存在せず、第八識と意根が存在している。(五)昏倒しているときやその他の時期には、五蘊の中でごく微弱な色蘊と識蘊だけが存在しているが、第八識と意根は影響を受けることなく存在し続けている。(六)阿羅漢が無余涅槃から出たばかりのときには、第八識と意根だけが存在し、五蘊はまだ出現していない。それゆえ、意根は完全に五蘊から独立できるが、第八識からは独立できないのである。(七)たとえ五蘊が存在している場合であっても、意根は完全に自分独自の心行を持つことができ、これらの心行は五蘊によって生じるものではない。
五蘊が絶えず運行する過程において、意根と五蘊には独立した側面もある。意根が五蘊を神様自身とみなしたり、あるいは五蘊を神様自身の所有物とみなし、自分の想法と意志を実現するための道具とみなすとき、そこにはすでに五蘊から独立しているという意味が含まれている。五蘊には第八識の属性がある。それは第八識が七大の種子によって変化して現出したものであり、至る所に第八識の情報が示されているのであり、実は五蘊の全体が第八識なのである。しかし、五蘊に意根の属性があると言うなら、それは五蘊が意根の習気に合致しており、意根の無明の結果だからである。
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