意根が疑を断じて信を生じてこそ、如来蔵 (tathāgatagarbha) ははじめて随順する

一切の万法は如来蔵を離れず、意根を離れて存在したり語られたりすることはできない。意識はただ補助的な役割を果たすに過ぎない。意識は参謀という脇役のようなものであり、意根こそが主役であり、将軍のようなものである。すべての決定権は意根にある。意識は参謀として、絶えず意根のために六塵の情報を収集し、六塵の詳細な情報を分析し、意根に適切で時宜にかなった合理的な提案を与えなければならない。

意根は意識が分析した情報と提案を受け取った後、自ら特有の思考と加工を行い、考慮を重ねた上で、意識が言うところの六塵に対する対処を行うかどうかを決定する。あるいは意根自身の経験に従い、自身の習慣に従い、自身の考え方や観念に従って次の行動を決定する。この全過程が意根の思心所の機能作用である。意根がまだ次の行動をどのように決定すべきか判断できない場合、やはり意識に再度情報を収集させて自己の参考に供する。それは将軍が決定できない時に参謀にさらに多くの有用な情報を収集させ、詳細に報告させて、将軍が再び決定を下すのを助けるのと同じである。

ここからわかるように、疑を断つには最も重要なのは意根の疑を断つことであり、意識の疑を断っても意根の疑は断たれず、意根は依然として疑いを持つことになる。（しかし意識の疑も、意根が解決を助けることがある。）例えば一家の主人に問題があれば、家族全体が彼に協力して問題を解決しなければならず、彼の問題が解決されなければ、家族全体が正常かつ秩序正しく運営することができない。

疑を断ち信を生むこと、疑を断つことも意根の疑を断つことであり、信を生むことも意根に信を生じさせることである。最初は意識の信であり、意識の信は迷信であり、盲信であり、不安定な信であり、正しい信ではない。正信であり深い信であるならば、それは意根の信であり、このような信は根深く、揺るぎないものである。意根に信がなければ、自ら進んで正しい法を修行しようとは思わない。意識がどれほど信じても、意根が疑いを起こせば意識はどうすることもできず、ただ意根の考えに従うしかない。意識はただ意根の参謀になるだけで、意根という将軍に代わって決定を下すことはできない。そして如来蔵と意根の関係は父子の関係のようなものであり、意根という息子が何かを望めば、如来蔵という父親は財力や物力や人材がある限り、その望みを叶えてやるのである。