意根と第八識の二つの識は密接に結びついており、意根は第八識なくして存在できず、離れれば滅びます。しかしながら、それぞれが独自の体性と心性を持ち、異なる機能を有することは妨げられません。意根が了別する対象は第八識が現じ出した法であり、了別すべき法が多岐にわたるため、智慧が微細でないと大まかな枠組みしか了別できません。細部にわたって了別するためには、六識の助力を得て初めて択ぶことが可能となります。第八識には自我性がなく、完全に業種に基づいて一切の法を造り出し、また因縁と意根の意欲に基づいて一切の法を生じさせます。第八識が何らかの法を運行する際には、必ず意根が同時に運行を伴い、もし妄執に満ちた世俗法を運行する必要がなければ、第八識は涅槃の境地に至り作為を止めます。
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